НДС остаётся главным источником налоговых доначислений по итогам выездных и камеральных проверок. По данным ФНС, в структуре доначислений по крупнейшим налогоплательщикам НДС устойчиво занимает первое место — нередко это 60–70% от общей суммы претензий. В 2026 году ситуация не изменилась: инспекции активно применяют автоматизированную систему контроля АСК НДС-3, а пороги для назначения выездных проверок снизились. Ниже — разбор пяти сценариев, по которым налогоплательщики получают доначисления чаще всего, с анализом правовой базы и практическими рекомендациями по защите.
Сценарий 1. Отказ в вычете по «техническому» контрагенту
Суть претензии. Инспекция устанавливает, что поставщик (подрядчик) обладает признаками «технической» компании: минимальный штат, отсутствие основных средств, транзитное движение денег, налоговая нагрузка близка к нулю. На этом основании ИФНС отказывает в вычете НДС по счетам-фактурам такого контрагента и доначисляет налог вместе с пенями и штрафом по пункту 1 статьи 122 НК РФ (20% от недоимки) или по пункту 3 той же статьи (40%, если вменяется умысел).
Правовая база. Статья 54.1 НК РФ устанавливает два условия правомерности вычета: (1) основная цель сделки не сводится к налоговой экономии; (2) обязательство исполнено именно тем лицом, которое указано в договоре, либо лицом, которому оно передало исполнение. Статьи 171–172 НК РФ определяют общий порядок применения вычетов: наличие счёта-фактуры, принятие товара (работы, услуги) на учёт, использование в облагаемой деятельности.
Где ИФНС часто ошибается. Налоговый орган нередко ограничивается формальными признаками «технической» компании, не исследуя реальность самой хозяйственной операции. Между тем Верховный суд последовательно указывает: отсутствие у контрагента ресурсов само по себе не опровергает реальность сделки, если товар фактически получен, работа выполнена, результат принят заказчиком. Бремя доказывания нереальности операции лежит на инспекции (часть 5 статьи 200 АПК РФ, пункт 6 статьи 108 НК РФ).
Как защищаться. Ключевой аргумент — доказать реальность операции независимо от «качества» контрагента: товарно-транспортные накладные, акты приёмки, переписка, пропуска на объект, показания сотрудников, принявших товар или результат работ. Если инспекция не оспаривает реальность, но настаивает на «техническом» посреднике, следует требовать налоговой реконструкции: доначисление должно производиться с учётом реально понесённых расходов и уплаченного НДС по цепочке (позиция ВС РФ, закреплённая в пункте 10 письма ФНС России от 10.03.2021 № БВ-4-7/3060@).
Сценарий 2. Дробление бизнеса и «слёт» с УСН — доначисление НДС за весь период
Суть претензии. Группа компаний или ИП применяет упрощённую систему налогообложения. ИФНС устанавливает, что несколько субъектов искусственно разделены с единственной целью — удержаться в лимитах УСН. Налоговый орган объединяет выручку, признаёт утрату права на УСН с начала квартала, в котором допущено превышение, и доначисляет НДС за весь период применения «неправомерной» упрощёнки. Суммы доначислений в таких делах нередко исчисляются десятками миллионов рублей.
Правовая база. Статья 54.1 НК РФ (искусственное дробление как форма злоупотребления правом). Статья 346.13 НК РФ: при превышении лимита выручки (в 2026 году — 450 млн рублей с учётом коэффициента-дефлятора) налогоплательщик утрачивает право на УСН с начала квартала превышения. Глава 21 НК РФ: с момента утраты права на УСН возникает обязанность исчислять НДС.
Важное изменение 2025–2026 годов. С 1 января 2025 года плательщики УСН с выручкой свыше 60 млн рублей в год признаются плательщиками НДС в обязательном порядке (статья 145 НК РФ в редакции Федерального закона от 12.07.2024 № 176-ФЗ). Это принципиально меняет логику дробления: теперь само по себе применение УСН не означает освобождения от НДС при превышении порога. Инспекции переориентировались: они по-прежнему оспаривают дробление, но акцент сместился на доначисление НДС по ставке 20% вместо льготных ставок 5% или 7%, которые применяет «упрощенец».
Как защищаться. Доказывать самостоятельность каждого субъекта: отдельные офисы, персонал, клиентская база, раздельный управленческий учёт, независимые поставщики. Если дробление всё же признано, добиваться налоговой реконструкции: НДС должен исчисляться расчётным методом из суммы выручки (то есть «изнутри», а не сверх неё), а уплаченный контрагентами НДС — приниматься к вычету.
Из практики. В деле, которое мы сопровождали в Сибирском федеральном округе (осень 2025 года), инспекция объединила выручку трёх ИП — членов одной семьи — и доначислила НДС за три года на сумму свыше 28 млн рублей. Нам удалось доказать, что каждый из предпринимателей вёл самостоятельную деятельность в разных сегментах рынка: один занимался оптовой торговлей, второй — розницей, третий — логистикой. Суд первой инстанции поддержал налогоплательщиков, указав, что инспекция не опровергла реальность раздельного ведения бизнеса и не исследовала деловую цель каждой из структур.
Сценарий 3. Восстановление НДС при переходе на необлагаемые операции или специальный режим
Суть претензии. Компания приняла НДС к вычету при приобретении товаров, основных средств или нематериальных активов, а впоследствии начала использовать их в операциях, не облагаемых НДС (освобождённых по статье 149 НК РФ), либо перешла на УСН. Инспекция требует восстановить ранее принятый к вычету НДС. Доначисление производится на основании подпункта 2 или 3 пункта 3 статьи 170 НК РФ.
Правовая база. Пункт 3 статьи 170 НК РФ содержит закрытый перечень случаев, когда НДС подлежит восстановлению. Подпункт 2: при передаче имущества в уставный капитал, при переходе на спецрежим. Подпункт 3: при использовании в необлагаемых операциях. По основным средствам и нематериальным активам восстановление производится пропорционально остаточной стоимости.
Типичные ошибки ИФНС. Инспекции расширительно толкуют перечень оснований для восстановления, требуя его в ситуациях, прямо не предусмотренных пунктом 3 статьи 170 НК РФ. Например, при списании товаров, при недостачах, при ликвидации основных средств. Верховный суд неоднократно указывал: перечень оснований для восстановления НДС является исчерпывающим, расширительное толкование недопустимо.
Как защищаться. Проверить, входит ли конкретная ситуация в закрытый перечень пункта 3 статьи 170 НК РФ. Если нет — оспаривать доначисление как не основанное на законе. Если восстановление законно — проверить правильность расчёта: по основным средствам восстанавливается НДС пропорционально остаточной (балансовой) стоимости без учёта переоценок, а не от первоначальной стоимости.
Сценарий 4. Занижение налоговой базы: невключение авансов, скрытая выручка, корректировки
Суть претензии. Инспекция в ходе камеральной или выездной проверки устанавливает расхождения между налоговой базой по НДС и данными банковских выписок, бухгалтерской отчётности или сведениями из деклараций контрагентов. Типичные эпизоды: не исчислен НДС с полученных авансов (пункт 1 статьи 167 НК РФ); выручка занижена по сравнению с данными расчётного счёта; не отражены операции по реализации, выявленные через АСК НДС-3.
Правовая база. Статья 146 НК РФ: объект налогообложения — реализация товаров, работ, услуг на территории РФ. Статья 154 НК РФ: налоговая база при реализации. Статья 167 НК РФ: момент определения налоговой базы — наиболее ранняя из дат: отгрузка или получение оплаты (аванса). Пункт 14 статьи 167 НК РФ: при получении аванса НДС исчисляется в момент получения.
Нюанс с авансами. Частая ошибка налогоплательщиков — не исчислять НДС с авансов, полученных в счёт предстоящих поставок, полагая, что налог возникнет при отгрузке. Это неверно. НДС с аванса исчисляется в квартале получения, а при отгрузке принимается к вычету (пункт 8 статьи 171, пункт 6 статьи 172 НК РФ). Если аванс получен и отгрузка произошла в одном квартале, НДС с аванса всё равно должен быть отражён в декларации — как начисленный и как вычет.
Как защищаться. При расхождении с банковской выпиской — доказывать, что поступления не являются выручкой от реализации: займы, возвраты, ошибочные платежи, суммы, поступившие в качестве агента. Каждое поступление должно быть квалифицировано с документальным подтверждением. При претензиях по АСК НДС-3 — проверять, не задвоены ли операции (например, один и тот же счёт-фактура отражён в нескольких книгах продаж).
Сценарий 5. Доначисление НДС налоговым агентом: иностранные услуги и аренда госимущества
Суть претензии. Российская компания приобретает услуги у иностранного поставщика, не состоящего на налоговом учёте в России, либо арендует федеральное или муниципальное имущество. В обоих случаях она обязана исполнить функции налогового агента по НДС: исчислить, удержать и перечислить налог в бюджет (статьи 161, 174 НК РФ). Если этого не сделано — инспекция доначисляет НДС, пени и штраф.
Правовая база. Статья 161 НК РФ: перечень случаев, когда российская организация признаётся налоговым агентом по НДС. Пункт 1: реализация иностранными лицами товаров (работ, услуг) на территории РФ. Пункт 3: аренда федерального и муниципального имущества у органов власти. Статья 174 НК РФ: налоговый агент уплачивает НДС одновременно с выплатой дохода иностранному лицу.
Актуальный контекст 2026 года. С расширением использования иностранного программного обеспечения, облачных сервисов и консалтинговых услуг иностранных компаний количество споров по агентскому НДС резко возросло. Особую сложность представляют ситуации, когда иностранный поставщик самостоятельно зарегистрировался в ФНС в порядке статьи 83 НК РФ и уплачивает НДС сам — в этом случае российская компания агентом не является. Инспекции нередко не учитывают этот факт и предъявляют претензии к покупателю.
Как защищаться. Проверить, зарегистрирован ли иностранный поставщик в ФНС России как плательщик НДС (реестр ФНС открыт). Если зарегистрирован и уплачивает налог самостоятельно — агентских обязанностей у покупателя нет. Если не зарегистрирован — убедиться, что место реализации услуг — территория РФ (статья 148 НК РФ): не все иностранные услуги облагаются НДС в России.
Из практики. В споре, который мы вели в Центральном федеральном округе (начало 2026 года), инспекция доначислила нашему клиенту — российской IT-компании — агентский НДС на сумму около 9 млн рублей по платежам за облачные сервисы иностранного вендора. Мы установили, что поставщик встал на учёт в ФНС России ещё в 2023 году и самостоятельно исчислял и уплачивал НДС. Доначисление было оспорено в полном объёме: суд согласился, что двойное взыскание НДС — и с агента, и с самого иностранного лица — противоречит существу налогового обязательства.
Что объединяет все пять сценариев
Во всех описанных случаях прослеживается одна закономерность: инспекция опирается на формальные признаки нарушения, не всегда исследуя существо хозяйственной операции. Налогоплательщик, который заранее выстраивает документальное подтверждение реальности своих сделок и понимает, где проходят границы допустимой налоговой экономии, имеет значительно больше шансов отстоять свою позицию — как на стадии возражений на акт проверки, так и в арбитражном суде.
Ключевые правила, которые работают во всех сценариях:
- Реальность операции важнее «качества» контрагента. Доказывайте факт исполнения сделки независимо от претензий к поставщику.
- Бремя доказывания лежит на инспекции. Налогоплательщик не обязан доказывать свою невиновность (пункт 6 статьи 108 НК РФ).
- Налоговая реконструкция — ваш инструмент, если нарушение всё же установлено. Доначисление должно отражать реальные налоговые обязательства, а не карательную арифметику инспекции.
- Процессуальные нарушения ИФНС — самостоятельное основание для отмены решения (пункт 14 статьи 101 НК РФ). Фиксируйте их с первого дня проверки.
- Сроки обжалования критичны: 1 месяц на апелляционную жалобу в УФНС (пункт 9 статьи 101.2 НК РФ), 3 месяца на заявление в арбитражный суд (часть 4 статьи 198 АПК РФ).
Если вы получили акт налоговой проверки с доначислением НДС или только ожидаете выездную проверку — обратитесь за консультацией. Мы разберём вашу ситуацию, оценим перспективы обжалования и выстроим стратегию защиты.
Об авторе
Автор статьи
Станислав Ластовский, старший юрист
Руководитель корпоративной практики. Веду юридическую практику с 2014 года. Специализируюсь на судебных и корпоративных спорах, банкротстве, защите от субсидиарной ответственности, спорах по интеллектуальной собственности. Выступаю спикером на профессиональных мероприятиях, даю экспертные комментарии для Континент-Сибирь, e-pepper, Банки-Сибирь.
Дата публикации: 29.05.2026